Discover and read the best of Twitter Threads about #L452R

Most recents (11)

BREAKING🔔 The 14th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out @biorxivpreprint. We illuminated the evolutionary rule underlying the convergent evolution of #Omicron and the virological characteristics of one of the latest lineages of concern, BQ.1.1. Please RT. 1/
biorxiv.org/content/10.110…
In late 2022, the Omicron subvariants have highly diversified. However, some lineages have convergently acquired amino acid substitutions at five critical residues in the spike protein: R346, K444, L452, N460 and F486. 2/
Omicron BQ.1.1 (aka #Cerberus), a descendant of BA.5, bears all five substitutions at the convergent sites: #R346T #K444T #L452R #N460K #F486V. 3/
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#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵のプレプリント第14弾「オミクロン亜株の収斂進化とBQ.1.1の性状解析」をbioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、オミクロン亜株の進化を描出し、 #オミクロン BQ.1.1(通称 #ケルベロス)の特徴を解明しました。以下まとめ⬇️ 1/
biorxiv.org/content/10.110…
2022年半ばのBA.5株の出現以降、世界を席巻する新しい変異株の出現が見られず、これまでのような「全とっかえ」の置き換わりが進んでいません。また逆に、世界中で多様化した #オミクロン亜株#収斂進化 していることが指摘されています。2/
2022年末現在、その最先端に位置するのが、5つのスパイクの収斂進化サイトの変異(#R346T #K444T #L452R #N460K #F486V)をコンプリートした、BQ.1.1株です。添付の系統樹が示すように、BQ.1.1はBA.5の子供にあたる株です。3/
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#SARSCOV2 hat den Jackpot geknackt: Ohne Isolations- und #Maskenpflicht kann es sich nun auf hohem Niveau verbreiten und seine Evolution vorantreiben, während die #Immunität schwindet.
Und das Mutationspotential ist gewaltig: #BA2+#L452R, #BA4, #BA5. Die Spitze des Eisbergs. 1/3
Selbst wenn nicht jede Re-Infektion schlimmer verläuft - #SARSCOV2 hinterlässt seine Spuren im Körper.
Die Liste der Organschäden wird immer länger.
„Super-Immunität“ ist eine reine Erfindung der #Durchseuchung-Fraktion.
Der häufige Kontakt wird uns langfristig schädigen. 2/3
Die Evidenz ist erdrückend:
Es gibt keine bleibende Immunität gegen #SARSCOV2.
Die Zahl der chronisch Kranken und deren Krankheitsbilder nimmt ständig zu.
Die Zahl der Varianten mit Fluchtmutationen ebenso.
Mit Wissenschaftsleugnung werden wir diese #Pandemie nicht beenden. 3/3
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#Impfstoffe, #Booster #Covax & #Kommunikation:

1) #AstraZeneca: #EMA STIKO und #Massenmedien, haben diesen Impfstoff so #kaputt #geredet, dass er ab Juli mehr unter die Leute zu bringen war. Es musste verdammt viel #weggeschmissen worden, statt #kreuzgeimpft (AZ+mRNA)

1/x
Obwohl sich abgezeichnet hat, dass eine #Erstimpfung mit #AstraZeneca und eine zeitlich verzögerte #zweite_Impfung mit einem mRNA Impfstoff, einer 2xmRNA Impfung mindestens gleichwertig ist, wurde dieses #heterologe_Impfschema kaum angewendet, da keine STIKO Empfehlung.

2/x
Die Schutzwirkung durch das #heterologe_Prime_Boost_Schema mit AZ + mRNA / #Kreuzimpfung, ist höher, und hält deutlich länger an als zweimal AZ
Dennoch hat man zweimal AZ mit kurzem Abstand zwischen beiden Dosen an Die verimpft, die überhaupt noch AZ imfwillig.

3/x
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Will the newly identified sub-lineages of #Delta may initiate a new wave of #Covid19 in India? What impact the increasing prevalence of the Delta-D clade would have on global #COVID burden?

My write-up deliberating on these issues in @TheWireScience 👇 science.thewire.in/the-sciences/a…
#Delta variant and its extended family: How much do we need to worry?

During the first few months of the #pandemic, the evolution of the virus was relatively predictable, with substitutions accumulating at a fixed pace: 1 substitution every second week 2/
In contrast, the 2nd year of the #pandemic is punctuated by the emergence of several #variants that bore evidence of dramatic evolution 3/
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BREAKING🔔 The 3rd preprint from G2P-Japan - we elucidated the evolution and virological phenotype of #Lambda variant (aka C.37 lineage). Lambda is resistant to vaccine-induced antiviral immunity. Please retweet 1/3
biorxiv.org/content/10.110…
Mutational anaysis showed that a large deletion in the N-terminal domain of the Lambda spike protein (246-253 residues) is responsible for the resiscence to neutralizing antibodies. 2/3
Moreover, #L452Q mutation in Lambda increases viral infectivity, like the case of #L452R mutation, a characteristic of #Delta. Our data suggest that 1) increasing viral infectivity and 2) evading antiviral immunity are crucial for the efficient spread in the human population 3/3
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#拡散希望 当ラボ主宰の新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japanのプレプリント第3弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に公開しました。本研究では、「注目すべき変異株 #VOI 」のひとつであり、南米で流行拡大する #ラムダ株 のウイルス学的特徴と進化動態を描出しました。1/5
biorxiv.org/content/10.110…
まず、#ラムダ株 が、ワクチンで誘導された #中和抗体 に強い抵抗性を示すことを明らかにしました。次に、ラムダ株特有の、スパイクタンパク質の大きな欠損変異(246-253欠損変異)が、このラムダ株の中和抗体抵抗性を規定していることを明らかにしました。2/5
分子系統学解析の結果、「246-253欠損変異」を持つ #ラムダ株 は、昨年7月頃に誕生し、その後南米各国で流行拡大したことが示唆されました。さらに、#ラムダ株 特有の #L452Q 変異が、#デルタ株#L452R 変異と同様に、ウイルスの感染力を増強させることを明らかにしました。3/5
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#CoronavirusUpdate 2021/6/1🇫🇷仏AFPが新型コロナ変異株のファクトファイルを公開。これまでの変異株をWHO指定の呼称「アルファ」「ベータ」「ガンマ」…で表記。興味深いことに #B16171 「カパ」についてはそこから派生した #B16172 を「デルタ」と表記。これではすぐに24字を使い果たしそうだ。
AFPはWHOが「懸念される変異株」(VOC)としてαアルファ・βベータ・γガンマ・δデルタ型とした4株のうち最初の3つと4つ目の「デルタ」を明確に区別。 α型 #B117 β型 #B1351 γ型 #P1 ら3変異株はいずれも #N501Y レセプターに変異がある型で、β型、γ型は #E484K #K417N レセプターに変異がある型と。 Image
一方、δデルタ型 #B16172 変異株は #E484Q #L452R レセプターに変異がみられる型であり、なぜかκカッパ型が #B16171 を指すようだが、このインフォグラフィックを正しく読めているのならば、 これら2種のレセプターに変異がみられる型が3系統存在する。

変異株の“進化“は止まることを知らない。 Image
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🧵Importante: la #variante #B1617 encontrada en #India es declarada variante de preocupación #voc por la @opsoms xke las mutaciones que porta sugieren que es más transmisible pero no hay datos sobre diagnósticos o eficiencia de #vacunas en este marco. Ahora, ¿qué es B1617?
La #variante #B1617 se le llama doble mutante xke porta 2 #mutaciones en la proteína espícula #E484Q y #L452R Estas 2 mutaciones están asociadas con más transmisibilidad dl #virus pero siempre se habían visto separadamente en distintas variantes. En B1617 se detectaron juntas
Fue detectada el pasado 5 de Octubre de 2020 en estado de Maharashtra en un 15 a 20% de casos y hoy ya forma el 60% aprox de casos en gran parte dl país. Además ha sido detectada en 21+ países. Su detección está asociada a las capacidades de #vigilanciagenomica del país!!
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Convergent evolution of #SARS_CoV_2 spike mutations, #L452R, #E484Q and #P681R, in the second wave of #COVID_19 in Maharashtra, #India | bioRxiv
#VUI biorxiv.org/content/10.110…
„newly identified lineage B.1.617 possessing common signature mutations D111D, G142D, L452R, E484Q, D614G and P681R, in the spike protein including within the receptor binding domain (RBD)“
„The structural analysis of RBD mutations L452R and E484Q along with P681R in the furin cleavage site, may possibly result in increased ACE2 binding and rate of S1-S2 cleavage resulting in better transmissibility.“
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Qu’est-ce que le variant indien "double mutant" B.1.617. ?

Un variant du #SARS_CoV_2 originaire d’Inde, décelé dès le 7/12/2020, qui pourrait être responsable d’une récente flambée des cas de 55% dans l’état du Maharashtra, après des mois de baisse. #COVID19 #DoubleMutant #B1617
C'est aussi un sujet d'inquiétude pour les scientifiques et l'état Indien, avec notamment 15-20% des PCR effectuées dans la province de Maharashtra, où circulent déjà le B.1.1.7 UK, le B.1.351 sud africain et le N440K, un ptit nouveau aussi #COVID19 #DoubleMutant #B1617
70% des séquences génomiques présentant les mutations B.1.617, et soumises à la base de données mondiale GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) proviennent d'Inde.
Puis du Royaume-Uni (23%), Singapour (2%) et de l'Australie (1%) #COVID19 #DoubleMutant #B1617
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